Думаю, оба в ручную кладь. С поверхности нового ноутбука убрать все внешние признаки свежести (напр., упаковку, пакет с инструкций и нераспакованными гаджетами, etc), если они есть. Важно одно - чтобы таможня РФ не нашла видимых оснований счесть новый ноутбук товаром, а ты мог сказать, что оба - твои личные вещи, необходимые тебе по работе.

См. тж.: http://www.customs.ru/ru/fl_info/ (часть II, "При въезде в Россию")